Yağışlı ve nemli iklim koşullarında gübreleme, ekime yakın dönemde yapılmalıdır. Çünkü yağışlar dolayısı ile bitki besin maddelerinde kayıplar artar. Çok sıcak ve kurak koşullarda ise gübreden buharlaşma ile kayıplar olabilmektedir. Bu durum göz önüne alınarak gübreleme zamanı ayarlanmalıdır.
Gübrelerin toprakta tutunabilmeleri için toprak koşullarının iyi bilinmesi gerekir. Hafif bünyeli topraklarda özellikle azotlu gübrelerin bölünerek uygulanması, kayıpların azaltılması açısından uygundur. Kireçli ve hafif alkali topraklarda ise verilen fosfor fiksasyona uğrar ve bitkinin yararlanamayacağı şekle dönüşür. Bu nedenle fosforlu gübrenin ekimden hemen önce hatta ekimle birlikte uygulanması gerekmektedir. Ayrıca her sene yaptırılacak toprak analizi sonuçları göz önünde bulundurularak toprağın ihitiyacı kadar gübreleme yapılmasına dikkat edilmelidir.
Sebzelerde ve yeni meyve bahçeleri tesis ederken kimyasal gübreler ekimle veya ekimden hemen sonra uygulanmalıdır. Meyve ağaçlarının gübreleme zamanı, bölgenin iklimine göre değişmekle birlikte ılıman bölgelerde Şubat- Mart aylarında, kışı şiddetli geçen bölgelerde ise Mart- Nisan aylarında yapılmalıdır. Yılın ilk gübrelemesinde önerilen fosforlu ve potasyumlu gübrenin tamamı ve azotlu gübrenin yarısı verilmelidir. Azotun diğer yarısı ise 2-3 ay sonra sulamadan hemen önce tırmıkla toprağa hafifçe karıştırılmalı ve daha sonra sulanmalıdır.
Uygulama zamanı; gübrenin organik ve inorganik formda olmasına ve bitki besin elementinin çeşidine göre değişmektedir.
